北检院专注科研测试-助力科技进步
您的位置: 首页 > 科研测试
科研测试   
RNA pulldown实验

RNA pulldown实验

CMA认证科研检测机构

集体所有制研究所

去咨询

原创版权 发布时间:2023-03-27 15:02:36 咨询量:1 来源:科研测试中心

注意:因业务调整,暂不接受个人委托测试,望见谅。

北检院检测平台-[科研实验室]可提供RNA pulldown实验服务,能力覆盖材料、生物、医药研究、医疗器械、化妆品、代谢组学测试、力学老化腐蚀性能测试、毒理学试验、动物模型实验、生物分析等。北检院材料实验室,根据相关检测标准,并提供测试报告,可在全国范围内使用并被认可。

RNA pull-down实验原理

RNA pull-down是检测RNA结合蛋白与其靶RNA之间相互作用的实验手段之一。使用体外转录法标记生物素RNA探针,然后与胞浆蛋白提取液孵育,形成RNA-蛋白质复合物。该复合物可与链霉亲和素标记的磁珠结合,从而与孵育液中的其他成分分离。复合物洗脱后,通过western blot实验检测特定的RNA结合蛋白是否与RNA相互作用。质谱实验检测特定的RNA结合蛋白鉴定蛋白质类型。

RNA pull-down实验技术流程

(1)目标RNA的制备及生物素标记。

目标RNA制备的一般流程包括:

构建RNA过表达质粒:基因合成+测序验证

体外转录模板准备:设计含T7启动子引物;PCR扩增得到转录模板

体外转录:以PCR产物为模板,体外转录得到目的RNA

(2)磁珠富集RNA

(3)RNA结合蛋白孵育

(4)RNA结合蛋白洗脱,银染质检:SDS-PAGE电泳银染检测富集蛋白的情况

(5)WB或者MS检测

ChIP、RIP、RNA pull-down、EMSA、荧光素酶报告基因的比较

ChIP:通过与染色质片段共沉淀和PCR技术,在体内检测与特异蛋白质结合的DNA片段。将处于适当生长时期的活细胞用甲醛交联后将细胞裂解, 染色体分离并打碎为一定大小的片段200bp-1000bp;然后用特异性抗体免疫沉淀目标蛋白与 DNA交联的复合物, 对特定靶蛋白与DNA片段进行富集。采用低pH值条件反交联, DNA与蛋白质之间的 Schiff键水解, 释放DNA片段。通过对目标片段的纯化与检测,获得DNA与蛋白质相互作用的序列信息。

研究目的:蛋白与DNA结合情况。

RIP:RIP技术(RNA Binding Protein Immunoprecipitation,RNA结合蛋白免疫沉淀),是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术。运用针对目标蛋白的抗体把相应的RNA-蛋白复合物沉淀下来,然后经过分离纯化就可以对结合在复合物上的RNA进行分析;即用抗体或表位标记物捕获细胞核内或细胞质中内源性的RNA结合蛋白,防止非特异性的RNA的结合,免疫沉淀把RNA结合蛋白及其结合的RNA一起分离出来,结合的RNA序列通过microarray (RIP-Chip),定量RT-PCR或高通量测序(RIP-Seq)方法来鉴定。是了解转录后调控网络动态过程的有力工具,能帮助我们发现miRNA的调节靶点。

研究目的:蛋白与RNA结合情况。

RNA pull-down实验

RNA pull-down:使用体外转录法标记生物素RNA探针,然后与胞浆蛋白提取液孵育,形成RNA-蛋白质复合物。该复合物可与链霉亲和素标记的磁珠结合,从而与孵育液中的其他成分分离。复合物洗脱后,通过western blot实验检测特定的RNA结合蛋白是否与RNA相互作用。

研究目的:蛋白与RNA结合情况。

EMSA:凝胶迁移或电泳迁移率实验(EMSA-electrophoretic mobility shift assay)是一种研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结合序列相互作用的技术,可用于研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结合序列相互作用、DNA定性和定量分析。生物素标记的探针依研究的结合蛋白的不同,可是双链或者是单链。

研究目的:蛋白与DNA结合情况。

荧光素酶报告基因:荧光素酶的基因可以被合成并插入到生物体中或转染到细胞中,将不同类型的细胞(骨髓干细胞、T细胞等)标记上(即表达)荧光素酶,就可以用高敏感度的CCD相机进行对动物体内进行活体观察而不会伤害到动物本身。在荧光素酶中加入正确的萤光素底物就可以放出荧光,而发出的光子可以被光敏感元件,如萤光探测器或改进后的光学显微镜探测到。这就使得对包括感染在内的多种生命活动进程进行观察成为可能。

研究目的:启动子激活情况。

北检院检测优势有哪些?

1、多个实验中心:实验室管理中心下设检测检测中心、科研检测中心、X射线应用中心。

2、面向众多学科:面向物理、化工化学、材料、纳米、环境、电子、能源等众多学科。

3、拥有多台精密检测仪器。

4、从事多项工作:能够从事材料微观结构检测、定性和定暨检测、材料性能检测、材料质量综合评定等工作。

5、全天化服务时间:提供24小时开放服务、网络化管理。

6、机构检测能力:具备向校内外科学研究和品质鉴定提供公正、科研检测数据能力的重要机构。

以上就是关于RNA pulldown实验的相关内容,更多检测需求,你可联系我们在线实验室工程师,为您详细洽谈实验周期及流程问题!

检测流程

1、收到客户的检测需求委托。

2、确立检测目标和检测需求

3、所在实验室检测工程师进行报价。

4、客户前期寄样,将样品寄送到相关实验室。

5、工程师对样品进行样品初检、入库以及编号处理。

6、确认检测需求,签定保密协议书,保护客户隐私。

7、成立对应检测小组,为客户安排检测项目及试验。

8、7-15个工作日完成试验,具体日期请依据工程师提供的日期为准。

9、工程师整理检测结果和数据,出具检测报告书。

10、将报告以邮递、传真、电子邮件等方式送至客户手中。

检测实验室(部分)

检测优势

1、综合性检测技术研究院等多项荣誉证书。

2、检测数据库知识储备大,检测经验丰富。

3、检测周期短,检测费用低。

4、可依据客户需求定制试验计划。

5、检测设备齐全,实验室体系完整

6、检测工程师专业知识过硬,检测经验丰富。

7、可以运用36种语言编写MSDS报告服务。

8、多家实验室分支,支持上门取样或寄样检测服务。

结语

以上是关于RNA pulldown实验的检测服务介绍,仅展示了部分检测样品和检测项目,如有其它需求或疑问请咨询在线工程师。

标签:RNA pulldown实验
 
咨询工程师