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高通量测序基因试验检测

高通量测序基因试验检测

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原创版权 发布时间:2023-08-09 13:34:05 更新时间:2024-12-08 04:29:07 咨询量:1 来源:生物医药测试中心

注意:因业务调整,暂不接受个人委托测试,望见谅。

  北检(北京)检测技术研究院可以针对基因组DNA样品、转录组RNA样品、小RNA样品、表观基因组DNA样品、单细胞样品等进行检测,可提供全基因组测序、目标区域测序、转录组测序、表观基因组测序、元基因组测序、单细胞测序、小RNA测序等检测服务,能够针对国标、美标等检测标准对样品进行检测,北检院专注科研测试,致力于推动科技进步,出具的高通量测序基因试验的检测报告多方认可。

  检测样品

  

显微镜下细胞切片

显微镜下细胞切片

  基因组DNA样品:用于全基因组测序(Whole Genome Sequencing,WGS)或目标区域测序(Targeted Sequencing)。基因组DNA样品可以来自生物体的细胞或组织,如人类、动物、植物等。

  转录组RNA样品:用于转录组测序(RNA-Seq)。转录组RNA样品可以来自细胞或组织,如细胞系、动物组织、植物组织等。

  小RNA样品:用于小RNA测序(Small RNA Sequencing)。小RNA样品包括microRNA(miRNA)、small interfering RNA(siRNA)等。

  表观基因组DNA样品:用于表观基因组测序(Epigenome Sequencing),如甲基化测序(DNA Methylation Sequencing)和染色质免疫沉淀测序(ChIP-Seq)。表观基因组DNA样品可以来自细胞或组织。

  单细胞样品:用于单细胞测序(Single-cell Sequencing)。单细胞样品可以来自单个细胞,可以是单个细胞悬液或单个细胞的分离物。

  检测项目

  全基因组测序(Whole Genome Sequencing,WGS):对一个生物体的完整基因组进行测序,可以用于研究基因组结构、变异、演化等。

  目标区域测序(Targeted Sequencing):选择性地测序感兴趣的基因或区域,可以用于研究特定基因的突变、关联分析等。

  转录组测序(RNA-Seq):测序细胞或组织中的转录本,可以用于研究基因表达水平、剪接变异、非编码RNA等。

  小RNA测序(Small RNA Sequencing):测序小RNA分子,如microRNA(miRNA),可以用于研究miRNA的功能和调控机制。

  表观基因组测序(Epigenome Sequencing):测序染色质上的表观遗传标记,如DNA甲基化、组蛋白修饰等,可以用于研究基因表观遗传调控。

  单细胞测序(Single-cell Sequencing):对单个细胞进行测序,可以研究细胞类型、细胞异质性、细胞发育轨迹等。

  元基因组测序(Metagenome Sequencing):测序环境样品中的微生物基因组,可以研究微生物群落结构、功能和代谢能力。

  检测方法

  样品准备:根据实验目的选择合适的样品类型(如基因组DNA、转录组RNA等),进行样品提取和纯化。这个步骤通常需要使用特定的试剂盒和方法,以获得高质量的核酸样品。

  DNA文库构建或RNA反转录:将提取的DNA或RNA样品进行文库构建或反转录,生成适用于测序的文库。文库构建的具体方法会根据测序技术和实验要求而有所不同,常见的方法包括PCR扩增、DNA片段连接、RNA逆转录等。

  测序平台选择:选择适合的高通量测序平台进行测序。目前常用的高通量测序平台包括Illumina HiSeq系列、NovaSeq系列、PacBio Sequel等。不同平台具有不同的测序原理、测序长度和产出量,选择合适的平台要考虑实验需求和预算限制。

  高通量测序:将构建好的文库进行高通量测序,生成原始测序数据。高通量测序的过程涉及到DNA扩增、测序反应、成像和数据采集等步骤,具体操作由测序平台的设备和软件完成。

  数据分析:对原始测序数据进行生物信息学分析,包括序列质量控制、序列比对、变异检测、基因表达分析等。数据分析通常需要使用专业的生物信息学工具和软件,如Bowtie、SAMtools、DESeq2等。

  结果解读和验证:根据数据分析结果进行结果解读,并进行验证实验以确认发现的基因变异、表达差异等。

  检测仪器

  

Illumina

  

PCR

  检测标准

  T/GDPMAA 0012-2023 高通量基因测序项目分类

  YY/T 1865-2022 BRCA基因突变检测试剂盒及数据库通用技术要求(高通量测序法)

  YY/T 1723-2020 高通量基因测序仪

  GB/T 35537-2017 高通量基因测序结果评价要求

  GB/T 33681.1-2017 高通量基因测序样本预处理方法 第1部分:动物组织样本预处理

  GB/T 30989-2014 高通量基因测序技术规程

  GB/T 40226-2021 环境微生物宏基因组检测 高通量测序法

  T/SZGIA 2-2018 人类全基因组遗传变异解读的高通量测序数据规范

  T/SZGIA 1.2-2018 基于高通量测序的环境微生物检测 第2部分:人粪便微生物宏基因组检测方法

  T/GDPMAA 0004-2020 基于孕妇外周血浆游离DNA高通量测序无创产前筛查胎儿基因组病技术标准

  DB32/T 3762.11-2020 新型冠状病毒检测技术规范 第11部分:全基因组高通量测序

检测流程

1、收到客户的检测需求委托。

2、确立检测目标和检测需求

3、所在实验室检测工程师进行报价。

4、客户前期寄样,将样品寄送到相关实验室。

5、工程师对样品进行样品初检、入库以及编号处理。

6、确认检测需求,签定保密协议书,保护客户隐私。

7、成立对应检测小组,为客户安排检测项目及试验。

8、7-15个工作日完成试验,具体日期请依据工程师提供的日期为准。

9、工程师整理检测结果和数据,出具检测报告书。

10、将报告以邮递、传真、电子邮件等方式送至客户手中。

检测实验室(部分)

检测优势

1、综合性检测技术研究院等多项荣誉证书。

2、检测数据库知识储备大,检测经验丰富。

3、检测周期短,检测费用低。

4、可依据客户需求定制试验计划。

5、检测设备齐全,实验室体系完整

6、检测工程师专业知识过硬,检测经验丰富。

7、可以运用36种语言编写MSDS报告服务。

8、多家实验室分支,支持上门取样或寄样检测服务。

结语

以上是关于高通量测序基因试验检测的检测服务介绍,仅展示了部分检测样品和检测项目,如有其它需求或疑问请咨询在线工程师。

标签:高通量测序基因试验;高通量测序基因试验检测
 
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